팩트체크넷이 일방적으로 사업을 중단하고 홈페이지마저 폐쇄하며 정부 예산을 ‘먹튀’했다는 김영식 국민의힘 의원 주장에 대해 팩트체크넷 청산인이 10일 반박문을 내고 “팩트체크넷은 민법과 팩트체크넷의 정관에 따라 정당한 해산 절차를 밟았고 방통위의 잔여재산 처분 허가를 받아 시청자미디어재단에 잔여재산을 기부하는 과정을 밟고 있다”고 설명했다. 또한 “국고 지원금에 따른 결과보고서와 보조금 사용 내역은 방통위가 정하는 원칙과 절차에 따라 정당하게 제출되었다”고 밝혔다.

팩트체크넷 구성과 운영이 편향됐다는 지적에 대해서도 “언론 현장에서 언론 직능단체들의 역할이 어떠한지에 대한 이해가 필요한 부분인 듯하다”고 반박했다. 김영식 의원이 “친민주당 친언론노조 성향의 직능단체”라고 비판한 한국기자협회와 방송기자연합회, 한국PD연합회 등은 “각각의 특성에 맞게 조직원들로 구성되어 있고 조직 내에는 진보와 보수, 중도 성향의 회원들이 모두 가입되어 있다”는 설명이다.

김영식 의원은 이날 국회 과학기술정보방송통신위원회가 방통위 등을 대상으로 진행한 국정감사에서 팩트체크넷의 재단 해산 과정과 운영의 편향성 문제 등을 제기하며 “사업 선정 단계부터 예산 집행까지 팩트체크넷에 대해서 전반적인 조사가 필요하다”고 주장했다. 이에 대해 이동관 방통위원장은 “이미 감사를 진행 중”이라며 “필요하다면 부당한 집행 내역을 환수 추진하고 부정한 사실이 적발되면 수사기관에 수사 의뢰까지 할 생각”이라고 밝혔다.